лавлагаа

Этиоп улсын Аваш мужийн Себаткило дахь Анофелес шумуулын шавьж устгах бодисын эсэргүүцлийн геномын хэмжээний популяцийн генетик ба молекулын хяналт

2012 онд Жибутид нээгдсэнээс хойш Азийн Anopheles stephensi шумуул Африкийн эвэрт тархсан. Энэхүү түрэмгий тээгч нь тив даяар тархсаар байгаа бөгөөд хумхаа өвчний хяналтын хөтөлбөрт ноцтой аюул учруулж байна. Шавьж устгах бодисоор эмчилсэн орны тор, дотор үлдэгдэл шүрших зэрэг тээгчийг хянах аргууд нь хумхаа өвчний ачааллыг мэдэгдэхүйц бууруулсан. Гэсэн хэдий ч Anopheles stephensi популяцийг оролцуулан шавьж устгах бодист тэсвэртэй шумуулын тархалт нэмэгдэж байгаа нь хумхаа өвчнийг устгах хүчин чармайлтад саад учруулж байна. Хүн амын бүтэц, популяцийн хоорондох генийн урсгал, шавьж устгах бодисын эсэргүүцлийн мутацийн тархалтыг ойлгох нь хумхаа өвчний хяналтын үр дүнтэй стратегийг удирдан чиглүүлэхэд чухал ач холбогдолтой юм.
An. stephensi хэрхэн HOA-д ийм байдлаар суурьшсан талаарх бидний ойлголтыг сайжруулах нь түүний шинэ газар нутагт тархах боломжийг урьдчилан таамаглахад чухал ач холбогдолтой юм. Популяцийн генетикийг векторын зүйлийг судлахад өргөнөөр ашиглаж ирсэн бөгөөд популяцийн бүтэц, үргэлжилж буй сонголт, генийн урсгалын талаар ойлголт авах боломжтой18,19. An. stephensi-ийн хувьд популяцийн бүтэц, геномын бүтцийг судлах нь түүний довтолгооны зам болон гарч ирснээс хойш гарсан аливаа дасан зохицох хувьслыг тодруулахад тусалдаг. Генийн урсгалаас гадна сонголт нь шавьж устгах бодисын эсэргүүцэлтэй холбоотой аллелийг тодорхойлж, эдгээр аллелууд популяцид хэрхэн тархаж байгааг тодруулж өгдөг тул онцгой чухал юм20.
Өнөөдрийг хүртэл Anopheles stephensi инвазив зүйлийн шавьж устгах бодисын эсэргүүцлийн маркер болон популяцийн генетикийг турших нь цөөн хэдэн нэр дэвшигч генээр хязгаарлагдсан. Энэ зүйлийн Африкт гарч ирсэн нь бүрэн ойлгогдоогүй байгаа ч нэг таамаглал нь хүн эсвэл малаар дамжин ирсэн гэсэн үг юм. Бусад онолуудад салхиар холын зайд нүүдэллэх зэрэг орно. Энэхүү судалгаанд ашигласан Этиопын тусгаарлагдсан нянгуудыг Аддис-Абабагаас зүүн тийш 200 км-т орших, Аддис-Абабагаас Жибути хүртэлх гол тээврийн коридор дээр орших Аваш Себат Кило хотоос цуглуулсан. Аваш Себат Кило нь хумхаа өвчний халдвар өндөртэй газар бөгөөд Anopheles stephensi-ийн олон тооны популяцитай бөгөөд энэ нь шавьж устгах бодист тэсвэртэй гэж мэдээлэгдсэн тул Anopheles stephensi8-ийн популяцийн генетикийг судлах чухал газар болгож байна.
Хортон шавьж устгах бодисын эсэргүүцлийн kdr L1014F мутаци нь Этиопын популяцид бага давтамжтайгаар илэрсэн бөгөөд Энэтхэгийн хээрийн дээжинд илрээгүй. Энэхүү kdr мутаци нь пиретроид болон DDT-д тэсвэртэй байдлыг бий болгодог бөгөөд өмнө нь 2016 онд Энэтхэг, 2018 онд Афганистанд цуглуулсан An. stephensi популяцид илэрсэн.31,32 Хоёр хотод пиретроид эсэргүүцэл өргөн тархсан байгаа хэдий ч kdr L1014F мутаци нь энд шинжилсэн Мангалор, Бангалор популяцид илрээгүй. Энэхүү SNP-ийг агуулсан Этиопын тусгаарлагдсан бичил биетний бага хувь нь гетерозигот байсан нь мутаци нь энэ популяцид саяхан үүссэн болохыг харуулж байна. Үүнийг Аваш хотод хийсэн өмнөх судалгаагаар нотолж байгаа бөгөөд энд шинжилсэн дээжүүдээс өмнөх жилд цуглуулсан дээжинд kdr мутацийн нотолгоо олдсонгүй.18 Бид өмнө нь ампликон илрүүлэх аргыг ашиглан ижил бүс нутаг/жилийн дээжийн багцад энэхүү kdr L1014F мутацийг бага давтамжтайгаар тодорхойлсон.28 Дээж авах цэгүүд дэх фенотипийн эсэргүүцлийг харгалзан үзвэл энэхүү эсэргүүцлийн тэмдэглэгээний аллелийн бага давтамж нь ажиглагдсан фенотипийг зорилтот цэгийн өөрчлөлтөөс бусад механизм хариуцдаг болохыг харуулж байна.
Энэхүү судалгааны хязгаарлалт нь шавьж устгах эмийн хариу урвалын талаарх фенотипийн мэдээлэл дутмаг байгаа явдал юм. Эдгээр мутаци нь шавьж устгах эмийн хариу урвалд үзүүлэх нөлөөллийг судлахын тулд геномын бүхэл бүтэн дараалал тогтоох (WGS) эсвэл зорилтот ампликоны дарааллыг мэдрэмтгий байдлын биошинжилгээтэй хослуулсан цаашдын судалгаа шаардлагатай байна. Эсэргүүцэлтэй холбоотой байж болох эдгээр шинэ missense SNP-үүдийг өндөр хүчин чадалтай молекулын шинжилгээнд хамруулж, хяналтыг дэмжиж, эсэргүүцлийн фенотиптэй холбоотой боломжит механизмыг ойлгож, баталгаажуулах функциональ ажлыг хөнгөвчлөх хэрэгтэй.
Товчхондоо, энэхүү судалгаа нь тив даяарх Anopheles шумуулын популяцийн генетикийн талаар илүү гүнзгий ойлголт өгөх болно. Геномын дарааллын шинжилгээг (WGS) янз бүрийн газарзүйн бүс нутагт дээжийн томоохон бүлэгт хэрэглэх нь генийн урсгалыг ойлгох, шавьж устгах бодисын эсэргүүцлийн маркеруудыг тодорхойлоход чухал үүрэг гүйцэтгэнэ. Энэхүү мэдлэг нь олон нийтийн эрүүл мэндийн байгууллагуудад векторын хяналт болон шавьж устгах бодисын хэрэглээнд мэдээлэлтэй сонголт хийх боломжийг олгоно.
Бид энэхүү өгөгдлийн багц дахь хуулбарын тооны хэлбэлзлийг илрүүлэхийн тулд хоёр аргыг ашигласан. Нэгдүгээрт, бид геном дахь тодорхойлогдсон CYP генийн кластеруудад анхаарлаа хандуулсан хамрах хүрээ дээр суурилсан аргыг ашигласан (Нэмэлт хүснэгт S5). Дээжийн хамрах хүрээг цуглуулгын байршлуудын дунджаар тооцоолж, Этиоп, Энэтхэгийн талбай, Энэтхэгийн колони, Пакистаны колони гэсэн дөрвөн бүлэгт хуваасан. Бүлэг бүрийн хамрах хүрээг цөмийн тэгшитгэл ашиглан хэвийн болгож, дараа нь тухайн бүлгийн геномын хамрах гүний дундажийн дагуу зурсан.


Нийтэлсэн цаг: 2025 оны 6-р сарын 23