querybg

Этиопийн Себаткило, Аваш дахь Anopheles шумуулын геномын популяцийн генетик ба шавьж устгах эсэргүүцлийн молекулын хяналт

2012 онд Жибутид олдсоноосоо хойш Азийн Anopheles stephensi шумуул Африкийн эвэрт тархсан байна. Энэхүү инвазив вектор тив даяар тархсаар байгаа нь хумхаа өвчний эсрэг тэмцэх хөтөлбөрүүдэд ноцтой аюул учруулж байна. Шавьж устгах үйлчилгээтэй орны тор, доторх үлдэгдэл шүрших зэрэг вектортой тэмцэх аргууд нь хумхаа өвчний ачааллыг эрс багасгасан. Гэсэн хэдий ч шавьж устгалд тэсвэртэй шумуул, түүний дотор Anopheles stephensi популяцийн тархалт нэмэгдэж байгаа нь хумхаа өвчнийг устгах үйл ажиллагаанд саад учруулж байна. Популяцийн бүтэц, популяци хоорондын генийн урсгал, шавьж устгах эсэргүүцлийн мутацийн тархалтыг ойлгох нь хумхаа өвчний эсрэг үр дүнтэй тэмцэх стратегийг удирдахад зайлшгүй шаардлагатай.
Хэрхэн бидний ойлголтыг сайжруулах нь Ан. stephensi нь HOA-д маш их суурьшсан нь түүний шинэ газар нутагт тархах боломжийг урьдчилан таамаглахад чухал ач холбогдолтой юм. Популяцийн генетикийг популяцийн бүтэц, үргэлжилж буй сонгон шалгаруулалт, генийн урсгалын талаарх ойлголтыг олж авахын тулд вектор төрлүүдийг судлахад өргөнөөр ашиглаж байна18,19. Ан. Stephensi, популяцийн бүтэц, геномын бүтцийг судлах нь түүний довтолгооны зам болон үүссэнээс хойш тохиолдсон аливаа дасан зохицох хувьслыг тодруулахад тусална. Генийн урсгалаас гадна сонгон шалгаруулалт нь шавьж устгах чадвартай холбоотой аллелуудыг тодорхойлж, популяцид хэрхэн тархаж байгааг тодруулж чаддаг учраас онцгой чухал юм20.
Өнөөдрийг хүртэл Anopheles stephensi-ийн инвазив төрөл зүйлийн шавьж устгах эсэргүүцлийн маркер болон популяцийн генетикийн туршилтыг цөөн тооны нэр дэвшигч генээр хязгаарлаж байна. Энэ зүйлийн Африкт үүссэн нь бүрэн ойлгогдоогүй байгаа боловч нэг таамаглал нь үүнийг хүн эсвэл малаар нутагшуулсан гэсэн таамаглал юм. Бусад онолуудад салхиар алсын зайн нүүдэл орно. Энэхүү судалгаанд ашигласан Этиопын тусгаарлалтыг Аддис-Абебагаас зүүн тийш 200 км-т орших, Аддис-Абебагаас Жибути хүртэлх тээврийн гол коридорт байрлах Аваш Себат Кило хотод цуглуулсан. Awash Sebat Kilo нь хумхаа өвчний тархалт ихтэй бүс бөгөөд Anopheles stephensi-ийн олон тооны популяцитай, шавьж устгах бодист тэсвэртэй гэж мэдээлсэн нь Anopheles stephensi8-ын популяцийн генетикийг судлах чухал газар юм.
Шавьж устгахад тэсвэртэй kdr L1014F мутаци нь Этиопын популяцид бага давтамжтайгаар илэрсэн бөгөөд Энэтхэгийн талбайн дээжинд илрээгүй. Энэхүү kdr мутаци нь пиретроид ба ДДТ-д тэсвэртэй бөгөөд өмнө нь Ан-д илэрсэн. stephensi популяцийг 2016 онд Энэтхэг, 2018 онд Афганистанд цуглуулсан.31,32 Хоёр хотод пиретроид эсэргүүцэл өргөн тархсан нь нотлогдсон хэдий ч энд дүн шинжилгээ хийсэн Мангалор болон Бангалорын популяцид kdr L1014F мутаци илрээгүй. Гетерозигот байсан энэхүү SNP-ийг агуулсан Этиопын тусгаарлагдмалуудын бага хувь нь энэ популяцид саяхан мутаци үүссэн болохыг харуулж байна. Үүнийг Awash-д хийсэн өмнөх судалгаагаар энд дүн шинжилгээ хийхээс өмнөх жил цуглуулсан дээжинд kdr мутацийн нотолгоо олдсонгүй.18 Бид өмнө нь ампликон илрүүлэх аргыг ашиглан нэг бүс/жилийн дээжийн багцад энэ kdr L1014F мутацийг бага давтамжтайгаар тодорхойлсон.28 Энэ нь сорьц авах бүх цэгийн фенотипийн эсэргүүцэл бага давтамжтай байгааг харуулж байна. өөрчлөлт нь энэхүү ажиглагдсан фенотипийг хариуцдаг.
Энэхүү судалгааны хязгаарлалт нь шавьж устгах хариу урвалын талаарх фенотипийн мэдээлэл дутмаг байна. Бүх геномын дараалал (WGS) эсвэл зорилтот ампликоны дарааллыг мэдрэмтгий байдлын био шинжилгээтэй хослуулсан цаашдын судалгаанууд нь шавьж устгах хариу урвалд эдгээр мутацийн нөлөөг судлах шаардлагатай. Эсэргүүцэлтэй холбоотой байж болох эдгээр шинэ алдаатай SNP-үүдийг эсэргүүцлийн фенотиптэй холбоотой боломжит механизмуудыг ойлгох, баталгаажуулах үйл ажиллагааны ажлыг хөнгөвчлөх, хяналтыг дэмжих зорилгоор өндөр хүчин чадалтай молекулын шинжилгээнд чиглүүлэх ёстой.
Дүгнэж хэлэхэд, энэхүү судалгаа нь тив даяарх Anopheles шумуулын популяцийн генетикийн талаар илүү гүнзгий ойлголтыг өгдөг. Бүхэл бүтэн геномын дараалал (WGS) шинжилгээг газарзүйн өөр өөр бүс нутагт дээжийн том бүлэгт ашиглах нь генийн урсгалыг ойлгох, шавьж устгах эсэргүүцлийн маркеруудыг тодорхойлох түлхүүр болно. Энэхүү мэдлэг нь нийгмийн эрүүл мэндийн байгууллагуудад векторын тандалт, шавьж устгах чиглэлээр мэдээлэлтэй сонголт хийх боломжийг олгоно.
Бид энэ өгөгдлийн багц дахь хуулбарын дугаарын өөрчлөлтийг илрүүлэх хоёр аргыг ашигласан. Нэгдүгээрт, бид геном дахь тодорхойлогдсон CYP генийн кластеруудад чиглэсэн хамрах хүрээг хамарсан аргыг ашигласан (Нэмэлт хүснэгт S5). Түүврийн хамрах хүрээг цуглуулах газруудад дунджаар тооцож, Этиоп, Энэтхэгийн талбай, Энэтхэгийн колони, Пакистаны колони гэсэн дөрвөн бүлэгт хуваасан. Бүлэг бүрийн хамрах хүрээг цөмийн тэгшитгэх аргыг ашиглан хэвийн болгож, дараа нь тухайн бүлгийн геномын хамрах гүний дагуу график зурсан.


Шуудангийн цаг: 2025 оны 6-р сарын 23-ны хооронд