DELLA уургууд нь хадгалагдсан мастер юмөсөлтийн зохицуулагчиддотоод болон хүрээлэн буй орчны дохиололд хариу үйлдэл үзүүлэх ургамлын хөгжлийг хянах гол үүрэг гүйцэтгэдэг. DELLA нь транскрипцийн зохицуулагчийн үүрэг гүйцэтгэдэг бөгөөд GRAS домэйноор дамжуулан транскрипцийн хүчин зүйлс (TFs) болон гистон H2A-тай холбогдож, промоторуудыг чиглүүлэхээр элсдэг. Сүүлийн үеийн судалгаагаар DELLA-ийн тогтвортой байдал нь хоёр механизмаар дамжин орчуулгын дараах зохицуулалттай байдаг болохыг харуулсан: фитогормон гиббереллиний өдөөгдсөн полиубиквитинжилт нь түүний хурдан задралд хүргэдэг бөгөөд хуримтлалыг нэмэгдүүлэхийн тулд жижиг убиквитин төст модификаторууд (SUMO)-ийн нэгдэл. Үүнээс гадна, DELLA-ийн идэвхжил нь хоёр өөр гликозилизациар динамикаар зохицуулагддаг: DELLA-TF харилцан үйлчлэл нь O-фукозилизациар нэмэгддэг боловч O-холбогдсон N-ацетилглюкозамин (O-GlcNAc) өөрчлөлтөөр дарангуйлагддаг. Гэсэн хэдий ч өмнөх судалгаанууд фосфоржуулалт нь DELL-ийн задралыг дэмждэг эсвэл бууруулдаг болохыг харуулсан судалгаанаас эхлээд фосфоржуулалт нь түүний тогтвортой байдалд нөлөөлдөггүй болохыг харуулсан бусад судалгаанууд хүртэл зөрчилтэй үр дүнг харуулсан тул DELLA фосфоржуулалтын үүрэг тодорхойгүй хэвээр байна. Энд бид РЕПРЕССОР дахь фосфоржуулалтын газруудыг тодорхойлсон.ga1-3(RGA, AtDELLA)-г Arabidopsis thaliana-аас массын спектрометрийн шинжилгээгээр цэвэршүүлсэн бөгөөд PolyS болон PolyS/T бүсэд хоёр RGA пептидийн фосфоржуулалт нь H2A холболтыг дэмжиж, RGA-ийн идэвхжилийг нэмэгдүүлдэг болохыг харуулж байна. RGA-ийн зорилтот промотортой холбоо. Фосфоржуулалт нь RGA-TF харилцан үйлчлэл эсвэл RGA-ийн тогтвортой байдалд нөлөөлдөггүй гэдгийг тэмдэглэх нь зүйтэй. Бидний судалгаагаар фосфоржуулалт нь DELLA-ийн идэвхжилийг хэрхэн өдөөдөг молекулын механизмыг харуулж байна.
DELLA функцийг зохицуулахад фосфоржуулалтын үүргийг тодруулахын тулд DELLA фосфоржуулалтын цэгүүдийг in vivo тодорхойлж, ургамалд функциональ шинжилгээ хийх нь чухал юм. Ургамлын хандыг аффинит цэвэршүүлсний дараа MS/MS шинжилгээ хийснээр бид RGA-д хэд хэдэн фосфозитыг тодорхойлсон. GA дутагдлын нөхцөлд RHA фосфоржуулалт нэмэгддэг боловч фосфоржуулалт нь түүний тогтвортой байдалд нөлөөлдөггүй. Хамгийн чухал нь co-IP болон ChIP-qPCR шинжилгээгээр RGA-ийн PolyS/T бүсэд фосфоржуулалт нь H2A-тай харилцан үйлчлэлцэх, зорилтот промотортой холбогдохыг дэмжиж, фосфоржуулалт нь RGA функцийг хэрхэн өдөөдөг механизмыг илчилдэг болохыг харуулсан.
RGA нь LHR1 дэд домэйны TF-тэй харилцан үйлчлэлцэх замаар хроматиныг онилохын тулд элсэж, дараа нь PolyS/T бүс болон PFYRE дэд домэйнээрээ дамжуулан H2A-тай холбогдож, RGA-г тогтворжуулахын тулд H2A-RGA-TF цогцолбор үүсгэдэг. DELLA домэйн болон GRAS домэйны хоорондох PolyS/T бүсэд Pep 2-ийн фосфоржуулалт нь тодорхойгүй киназагаар RGA-H2A холболтыг сайжруулдаг. rgam2A мутант уураг нь RGA фосфоржуулалтыг зогсоож, H2A холболтод саад учруулахын тулд өөр уургийн конформацийг ашигладаг. Энэ нь түр зуурын TF-rgam2A харилцан үйлчлэлийг тогтворгүйжүүлж, rgam2A-г зорилтот хроматинаас салгахад хүргэдэг. Энэ зурагт зөвхөн RGA-зуучлалтай транскрипцийн дарангуйллыг харуулсан болно. RGA-зуучлалтай транскрипцийн идэвхжлийн хувьд ижил төстэй хэв маягийг тодорхойлж болох боловч H2A-RGA-TF цогцолбор нь зорилтот генийн транскрипцийг дэмжиж, rgam2A-ийн фосфоржуулалтгүйжүүлэлт нь транскрипцийг бууруулна. Зураг нь Huang et al.21-ээс өөрчлөгдсөн.
Бүх тоон өгөгдлийг Excel ашиглан статистикийн шинжилгээ хийсэн бөгөөд мэдэгдэхүйц ялгааг Стьюдентийн t тест ашиглан тодорхойлсон. Түүврийн хэмжээг урьдчилан тодорхойлоход статистикийн аргыг ашиглаагүй. Шинжилгээнээс ямар ч өгөгдлийг хасаагүй; туршилтыг санамсаргүй байдлаар сонгоогүй; судлаачид туршилтын явцад өгөгдлийн тархалт болон үр дүнгийн үнэлгээнд сохор байгаагүй. Түүврийн хэмжээг зургийн домог болон эх сурвалжийн өгөгдлийн файлд заасан болно.
Судалгааны дизайны талаар дэлгэрэнгүй мэдээллийг энэ нийтлэлтэй холбоотой Байгалийн Портфолиогийн тайлангийн товч агуулгаас үзнэ үү.
Массын спектрометрийн протеомик өгөгдлийг PXD046004 өгөгдлийн багц танигчтай PRIDE66 түншийн сангаар дамжуулан ProteomeXchange консорциумд оруулсан. Энэхүү судалгааны явцад олж авсан бусад бүх өгөгдлийг Нэмэлт мэдээлэл, Нэмэлт өгөгдлийн файлууд болон Түүхий өгөгдлийн файлуудад үзүүлэв. Эх сурвалжийн өгөгдлийг энэ нийтлэлд зориулав.
Нийтэлсэн цаг: 2024 оны 11-р сарын 8